Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPHNQ9NQX3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPHNQ9NQX3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms