Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A4GALTQ9NPC4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4GALTQ9NPC4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms