Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPCPD1Q9NPB8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPCPD1Q9NPB8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms