Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VTA1Q9NP79 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms