Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAT1LQ9HCJ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1LQ9HCJ6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms