Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LY9Q9HBG7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LY9Q9HBG7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms