Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMYD3Q9H7B4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD3Q9H7B4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms