Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLR1EQ9GZS1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms