Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDGFDQ9GZP0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDGFDQ9GZP0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms