Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSER1Q9C0I3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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