Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCAPERQ9BY12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCAPERQ9BY12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms