Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNF17Q9BXT8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF17Q9BXT8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF17Q9BXT8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms