Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
PRXQ9BXM0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRXQ9BXM0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms