Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLVAPQ9BX97 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLVAPQ9BX97 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms