Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF5Q99942 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF5Q99942 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms