Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYD88Q99836 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYD88Q99836 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms