Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLCC1Q96S66 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLCC1Q96S66 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms