Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEUROD6Q96NK8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms