Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMTM3Q96MX0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms