Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms