Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUSD3Q96L08 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUSD3Q96L08 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms