Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG3Q96JB2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COG3Q96JB2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COG3Q96JB2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms