Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCC12Q96J65 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCC12Q96J65 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms