Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED3Q96IU2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED3Q96IU2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
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