Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIN37Q96GY3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIN37Q96GY3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms