Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NEIL1Q96FI4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NEIL1Q96FI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms