Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FAF2Q96CS3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FAF2Q96CS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms