Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCC1Q96CN9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCC1Q96CN9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms