Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ZNF428Q96B54 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF428Q96B54 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms