Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMO7Q8WWI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMO7Q8WWI1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms