Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf3Q8WVX3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C4orf3Q8WVX3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms