Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX33Q8WV41 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX33Q8WV41 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX33Q8WV41 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX33Q8WV41 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNX33Q8WV41 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX33Q8WV41 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms