Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PNLDC1Q8NA58 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms