Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARHGEF28Q8N1W1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF28Q8N1W1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF28Q8N1W1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF28Q8N1W1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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