Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTU1Q7Z7A3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms