Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP6Q7Z6E9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP6Q7Z6E9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms