Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms