Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO3Q6UWJ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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