Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q6Q795 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q6Q795 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q6Q795 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms