Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1Q6PKG0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms