Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC137Q6PK04 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC137Q6PK04 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms