Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40BQ6NWY9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRPF40BQ6NWY9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms