Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC9A4Q6AI14 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC9A4Q6AI14 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms