Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CREB3L3Q68CJ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CREB3L3Q68CJ9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms