Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf135Q5VTT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf135Q5VTT2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms