Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDLRAD1Q5T700 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LDLRAD1Q5T700 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms