Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CC2D1BQ5T0F9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms