Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP188Q5SRE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms