Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR44Q5JSH3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms