Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA8Q53HL2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms